Emelyn Weber est engagée depuis ses 14 ans à la Jeunesse Ouvrière Chrétienne (JOC), dont le but est que les jeunes puissent, à travers l’action, être acteur.rice.s de leur vie et prendre place dans la société. A la fédération de Metz (Lorraine) qu'elle a présidé jusqu'à 2017, elle a pu vivre de nombreux projets collectifs et locaux par, pour et avec les jeunes. Au CESE, elle représente également le Forum Français de la Jeunesse (FFJ), espace de représentation des jeunes par eux-mêmes et dont la JOC est une des organisations membres.

En décembre 2016, elle a co-rapporté un avis sur la construction d'une Europe dotée d'un socle des droits sociaux et en mai 2018, un avis sur les parcours et politiques d’accueil des demandeur.euse.s d’asile dans l’Union Européenne. Elle est présidente de la Délégation aux Droits des Femmes et à l'Égalité.